# Nederlands Deze pagina bevat de documentatie voor het progamma TB-Profiler, die [hier](https://genomemedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13073-019-0650-x) gepubliceerd is. TB-Profiler kan NGS data analyseren om resistentie tegen drugs en *M. tuberculosis* stam te voorspellen. Ik ontwikkel en verbeter het progamma regelmatig. Als je TB-Profiler wil gebruiken, gebruik dan alsjeblieft de meest recent versie. ## Installeren Je kunt conda gebruiken om TB-Profiler te installeren. Zorg er eerst voor, dat je het bioconda-channel geaktiveerd hebt. ``` conda config --add channels defaults conda config --add channels bioconda conda config --add channels conda-forge ``` Installeer vervolgens TB-Profiler. ``` conda install -c bioconda tb-profiler ``` ## Gebruik Als je twee bestanden hebt (reads\_1.fastq.gz en reads\_2.fastq.gz) dan kan je de volgende opdracht gebruiken om resistentie tegen drugs en *M. tuberculosis* stam te voorspellen. ``` tb-profiler profile -1 reads_1.fastq.gz -2 reads_2.fastq.gz -p prefix ``` De `-p` parameter kan woorden gebruikt om de resultaten een unique naam te geven. Als je een bam bestand hebt dan kan je het `-a` parameter gebruiken. ``` tb-profiler profile -a arquivo.bam -p prefix ``` Om meerdere resultaten (samen) te combineren, kun je de`collate` functie gebruiken. ``` tb-profiler collate ```